Les séances de zoothérapie peuvent avoir lieu en petit groupe (maximum 10 personnes) ou en individuel avec des visites dans les chambres ou dans les lieux de vie. Les objectifs de ces séances sont définis ensemble avec les équipes professionnelles qui entourent les bénéficiaires.

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Chaque séance, en groupe ou individuelles fait l'objet d'un rapport écrit rendant compte notamment des objectifs thérapeutiques, de la disposition de la personne et de ses réactions. 

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Afin de pouvoir mettre en place un vrai suivi personnalisé et d'obtenir des bénéfices sur le long terme, des séances régulières sont privilégiées. Néanmoins, des séances ponctuelles peuvent être envisagées. ​​